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手把手教你做全基因组DNA甲基化测序分析

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发表于 2022-6-18 16:42:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
  大家好,这是专注表观组学十余年,快速全基因组测序领跑多组学科研服务的易基因。
  本期,我们讲讲全基因组DNA甲基化实验怎么做,从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。
  全基因组甲基化测序技术原理
  表观修饰不需要改变 DNA 序列便能实现对性状的改变,表观修饰的改变与基因功能乃至细胞状态、发育、衰老、疾病等存在重要的关联。在众多的表观遗传修饰中,最为重要且研究最为广泛的修饰之一是 DNA 甲基化,而全基因组甲基化测序(WGBS-seq)无疑是最有效的研究手段。
  全基因组甲基化测序利用重亚硫酸盐能够将未甲基化的胞嘧啶(C)转化为胸腺嘧啶 (T)的特性,将基因组用重亚硫酸盐处理后测序,即可根据单个 C 位点上未转化为 C 未转化为 T 的 reads 数目与所有覆盖的 reads 数目的比例,计算得到甲基化率。该技术对于全面研究胚胎发育、衰老机制、疾病发生发展的表观遗传机制,以及筛选疾病相关的表观遗传学标记位点具有重要的应用价值。


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